超聲波清潔機作業頻率很低（在人的聽覺范圍內）就會發生噪音。當頻率低于20kHz時，作業噪音不僅變得很大，并且也許超出工作安全與保健法或其它法令所規定的安全噪音的極限。在需要高功率去掉塵垢而不必考慮工件外表損害的運用中，通常挑選從20kHz到30kHz范圍內的較低清潔頻率。該頻率范圍內的清潔頻率常常被用于清潔大型、重型零件或高密度資料的工件。

低頻通常被用于清潔較小、較精細的零件，或鏟除細小顆粒。超聲波清潔機高頻還被用于被工件外表不允許損害的運用。運用高頻可從幾個方面改進清潔性能。跟著頻率的添加，空化泡的數量呈線形添加，然后發生更多更密集的沖擊波使其能進入到更小的縫隙中。假如功率堅持不變，空化泡變小，其開釋的能量相應削減，這樣有效地減小了對工件外表的損害。高頻的另一個優勢在于減小了粘滯邊界層。

超聲波清潔機空化效果即是超聲波以每秒兩萬次以上的緊縮力和減壓力交互性的高頻改換方法向液體進行透射。在減壓力效果時，液體中發生真空核群泡的景象，在緊縮力效果時，真空核群泡受壓力壓碎時發生強壯的沖擊力，由此剝離被清潔物外表的塵垢，然后達到精細洗凈目的。

超聲波在液體中沿聲的傳達方向發生活動的景象稱為直進流。聲波強度在0.5W/cm2時，肉眼能看到直進流，垂直于振動面發生活動，流速約為10cm/s。超聲波清潔機通過此直進流使被清潔物外表的微油塵垢被拌和，塵垢外表的清潔液也發生對流，溶解污物的溶解液與新液混合，使溶解速度加快，對污物的搬運起著很大的效果。

液體粒子推進發生的加速度。關于頻率較高的超聲波清潔機，空化效果就很不明顯了，這時的清潔主要靠超聲波清潔機液體粒子超聲效果下的加速度碰擊粒子對污物進行超精細清潔。