超聲波清洗器清洗是頭堆生產過程中的一道重要工序。目的是在不破壞頭堆的本身性能和參數的前提下把頭堆上的臟污、松香、膠、松散的碎錫等去除掉，達到非常高的清潔度。
其具體步驟是：在裝有0.2%清洗劑的清洗缸內對磁頭進行超聲波清洗器清洗，在裝有DI(去離子水)循環水的預漂洗缸內對磁頭進行超聲波預漂洗，然后在裝有DI循環水的**終漂洗缸內對磁頭進行超聲波**終漂洗，再在烘干缸內除水烘干，**后在真空缸內進一步除水烘干，完成清洗過程。
公司的超聲波清洗器采用的是美GCREST公司制作的PCS 2224清洗機，其超聲波頻率為64 kHz。超聲波清洗原理是：缸底的超聲波振子產生的超聲波，通過清洗缸底部傳入液體中，使液體產生擠壓和擴張的交變力，在這種交變力的作用下，液體受擴張力產生密集的空穴，液體受擠壓時空穴就破裂消失。由于是高頻振動，不斷產生空穴又不斷使空穴破裂，這種現象對浸在液體中的物體表面產生沖擊侵蝕作用，將附著在被清洗物表面的物質剝蝕掉。超聲波清洗器清洗就是利用這種原理來清除物體表面的臟物。超聲波強度與頻率對清洗效果是兩個非常重要的參數。
(1)超聲波強度對清洗效果的影響
一般來說，超聲波清洗器超聲波強度越高，則清洗效果越好，如圖1所示。但并不是說超聲波強度可以非常高，因為磁頭是一種非常嬌貴的東西極容易受到損壞，如果強度太高，磁頭就會出現斷線，掉頭(浮動塊從彈性臂上脫落下來)、舌片斷裂等。
(2)超聲波頻率對清洗效果的影響
計算機硬盤磁頭技術在不斷地發展，CMR磁頭，MR磁頭已逐漸取代MIG磁頭，并且結構、尺寸越來越趨于小型化。對于小尺寸的磁頭，尤其在其狹窄的縫隙里，臟污不容易清洗。這是因為由超聲波清洗器超聲波產生的空穴的尺寸可能大于縫隙的尺寸，液體不容易進入縫隙，故縫隙中的臟污也就無法清洗到。為了解決此矛盾，只有提高超聲波的頻率。頻率越高，產生的空穴就越細密，因此，也就容易清洗到狹縫了。